Research Package 阅读页

这里展示一个正式研究包应如何被阅读、核对和复现。当前公共站点没有获批公开的完整研究包，因此不会把私有项目、候选或未授权 Artifact 伪装成公开案例。

按指南了解研究流程 →查看公开方法案例

PACKAGE CONTRACT

一个可复核的科研成果包应包含什么

阅读页把研究问题、候选身份、三轴证据、研究者判断与文件来源放在同一上下文中。证据缺失会保留为缺失状态，而不是用空值或装饰性分数填充。

研究问题: 物种 × 受体底物 × 糖供体
候选范围: UGT Table / 选择来源 / 版本
科学证据: Evolution · Structure · Biology
研究判断: Priority · Coverage · Decision 分开

建议的阅读顺序

Overview：确认研究问题、物种、底物、供体和候选范围。
Evidence：逐轴查看状态、来源、方法版本和局限。
Decision：核对研究者判断是否有理由与证据引用。
Outputs：检查报告、图表、原始 Artifact 和 manifest 是否一致。

METHOD AT A GLANCE

从研究上下文到可追溯输出

UGTLD 从物种、底物和糖供体到候选中心与研究输出的方法示意 — 方法示意 · 不是实验结果；Evidence、Coverage、Priority 和 Researcher Decision 保持独立。

EVIDENCE MATRIX

状态、来源与限制必须同时可见

轴 / 输出	状态	应显示的来源	科学解释
Evolution	PUBLIC METHOD ONLY	序列、参考库、分析版本、树文件	家族与序列背景不单独确认底物或供体特异性。
Structure	NOT PUBLIC	结构 Artifact、donor-first 参数、几何诊断	模型与对接支持研究假设，不等于酶活。
Biology	UNAVAILABLE PUBLICLY	组学数据集、样本元数据、映射版本	无获批数据时保留缺失，不把缺失解释为零。
Researcher Decision	PRIVATE ONLY	理由、引用证据、历史版本	Priority、Coverage 与研究者判断独立维护。

CANDIDATE SUMMARY

没有获批公开的候选记录

此处保留正式阅读器的候选字段，但当前不载入任何私有项目、候选编号或实验结果。

Candidate ID	Species	Priority	Coverage	Researcher Decision
PUBLIC_APPROVED_CASE 未配置 · 无公开记录

FILE MANIFEST · TEMPLATE

研究包文件结构

README.md
project_metadata.json
candidate_space/
  ugt_table.tsv
  selection_provenance.json
evidence/
  evolution/
  structure/
  biology/
reports/
  candidate_report.html
  project_report.html
figures/
provenance/
  methods.json
  artifact_manifest.json
limitations.md

这是公开阅读契约的文件树模板，不代表当前已有一个可下载的公开 ZIP。

TRACEABILITY

下一步如何进入真实研究

获批研究者从 Research Workspace 打开项目后，Research Package 会继承项目、候选、物种、底物、供体与分析版本上下文。公共页面只说明阅读方式，不创建项目、不保存 Decision，也不开放私有 Artifact。

当一个真实案例获得公开许可后，这个页面可替换为同样结构的脱敏只读预览，并逐项链接来源、图表和 manifest。

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